14年前,初号机疑似神(shén )化第一形(xíng )态的(de )觉醒带来(lái )近三(sān )冲击,使世(shì )界发(fā )生前所未有的巨变。在此之后,葛城美里(三石琴乃 配音)等NERV旧部(bù )出走,成立(lì )了反(fǎn )抗seele和NERV的Wille。Wille授(shòu )命明(míng )日香(宫村优(yōu )子 配音)和真里(坂本真绫 配音)夺回被封印在(zài )卫星轨道(dào )上的(de )初号机和(hé )碇真(zhēn )嗣(绪方(fāng )惠美(měi ) 配音),但绝对禁止真嗣登上初号机。感受到周遭的敌意,懵懂的真(zhēn )嗣跟随绫(líng )波丽(lì )(林原惠(huì )美 配(pèi )音)登上突然入侵的九号机,返回了千疮百孔的NERV总部。在这里,他意(yì )外重逢朝(cháo )思夜(yè )想的绫波(bō ),还从(cóng )父亲那里(lǐ )得知(zhī )自己将和美少年渚薰(石田彰